本篇资讯源自《国家传染病医学中心信息快报-7月版》
该论文的研究人员独辟蹊径地针对SARS-CoV-2 NSP3蛋白展开研究。该团队在前期解析了 SARS-CoV-2 NSP3的木瓜样蛋白酶结构域(PLpro)的结构,基于PLpro靶点进行了化合物筛选,发现了新型抗病毒分子(Gao et al., Acta Pharmaceutica Sinica B 2021, Yuan et al., Protein & Cell 2022)。
在最新的研究中,该团队解析了SARS-CoV-2 NSP3的另一个重要结构域“SUD”的高分辨率结构(1.35埃)。SUD由SUD-N 和SUD-M两个亚结构域构成。SARS-CoV SUD-M和SUD-N之间通过一个二硫键彼此连接,但SARS-CoV-2 SUD-M 和SUD-N之间的二硫键在进化的过程中丢失。
为了稳定SARS-CoV-2 SUD以解析其结构,该团队引入了一个类似SARS-CoV SUD的二硫键,从而成功解析了SARS-CoV-2 SUD的高分辨率结构。然而,当研究人员将相同的二硫键引入SARS-CoV-2的RNA基因组中,他们发现突变病毒无法被拯救。这些研究结果表明SARS-CoV-2和 SASR-CoV的SUD之间存在重要差异。
接下来,该团队系统研究了SARS-CoV-2 SUD与Poly-A结合蛋白(Paip1) 以及RNA G四联体(G4)的相互作用,构建了基于SUD亲和力的小分子化合物高通量筛选体系,获得了一系列特异性结合SUD的化合物。其中,TF3与SARS-CoV-2 SUD的结合力较强,能够破坏SUD-G4的相互作用。
最终,研究团队证明TF3能够抑制SARS-CoV-2病毒在细胞中的复制,具有显著的抗病毒活性。这些研究成果初步确证了SUD作为抗病毒靶点的有效性。