新冠动态丨Nature Microbiology发文：Ct值大于35时，到底是否还有传染性？

病毒感染是个相当复杂的过程，病毒的复制和清除均受到宿主和病毒相互作用的影响。认识病毒复制和清除的动态过程，对制定有效的隔离、筛查和检测等公共卫生方案具有重要的作用。

2020年秋天至2021年春天，伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校（UIUC）对校内职工和学生进行了至少每周2次的SARS-CoV-2的PCR检测，共纳入了60例符合入选标准的受试者，即纳入研究7天前SARS-CoV-2的PCR结果阴性且24小时内检测结果阳性或5天内与阳性患者有密接接触史。对受试者进行了连续14天的鼻拭子和唾液采样，描述每个受试者的病毒动态变化过程。研究同时进行了抗原检测和病毒分离培养。研究结果在Nature Microbiology上进行了发表。

研究结果显示，绝大部分的病例中，病毒载量在鼻拭子或唾液样本中都出现了升高和下降的动态变化。大部分患者在发病12天后鼻拭子和唾液样本的病毒Ct值介于30-40之间，所有标本的病毒分离培养从第9天开始不能分离出病毒，提示此时病毒已不在具有传染性。约有93%的受试者在病毒分离培养阳性时同时抗原检测阳性。

图1. SARS-CoV-2每日检测的动态变化。a. 唾液标本（蓝绿色点）qPCR结果，鼻拭子标本（蓝色点）qPCR结果，鼻拭子病毒分离培养（红色叉）和抗原阳性标本（深黄色填充）。左侧y轴代表唾液和鼻拭子标本的Ct值；右侧y轴代表病毒培养结果。点状垂直线代表鼻拭子Ct值最低的时间，短划水平线代表RT-qPCR和病毒培养的检测下限。b. 病毒培养阳性的不同时间点的Ct值。c. 抗原结果。

该研究通过建立不同的数学模型，更全面地阐述了不同个体间病毒的动态变化差异。鼻拭子和唾液标本中病毒动态变化不同。鼻拭子样本中，病毒载量在达到峰值后快速下降，而后速度逐渐减慢。唾液标本中，病毒载量在达到峰值后的下降速度较鼻拭子标本有所减慢。研究计算了鼻拭子和唾液标本中，病毒载量从感染到峰值的平均时间分别为4.9天（±0.5天）和3.9天（±0.8天），病毒载量从峰值到检测下限的平均时间分别为22.3天（±8.3天）和14.9天（±3.2天）。

图2. 唾液标本（蓝绿色点）和鼻拭子标本（蓝色点）的RT-qPCR结果的拟合曲线。

研究进一步评估了病毒的传染性，qPCR的Ct大于35时，样本不再分离出传染性病毒；Ct值大于28时，感染者基本无病毒脱落。

图3. 不同个体传染性病毒脱落的异质性。a. 鼻拭子病毒培养阳性的天数分布。b. 年龄和病毒培养阳性天数的标准线性回归分析。c. Ct值和病毒培养阳性概率的相关性。d. Ct值与传染性病毒脱落的相关性。e. 感染过程中经鼻腔排出的传染性病毒的预计总累计水平分布。f. 年龄与预计传染性病毒总体脱落的关系。

受限于研究时间，该研究并未包括目前正在流行的奥密克戎毒株，但是针对Alpha突变株（B.1.1.7）和之前流行的非VOC突变株的动态监测，对公共卫生措施的制定具有非常重要的参考意义。

文献：

Ke R, et al. Nat Microbiol. 2022. PMID: 35484231

撰文/编辑：喻一奇